Ton serveur SQL (hébergé sur le web) possede une adresse IP publique ou un DNS.
Du coup dans la ConnectionString de ton application, tu peux spécifier l'adresse IP de ton server sql ou le DNS dans la data source.
Du coup la ConnectionString de ton application sera a peu pret commme:
Data Source=XXX.XXX.XXX.XXX;Initial Catalog=MaBaseDeDonnee;User Id=MonUser;Pwd=MonMotDePasse;
XXX.XXX.XXX.XXX => c'est l'adresse IP de ton serveur SQL
Attention, si ton serveur SQL utilise un firewall, pense à autoriser les ports 1432 et 1433, qui sont les ports de communication de SQL server.
Voici le lien de la msdn qui se rapporte à ton problème:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms175483(SQL.90).aspx
J'espère que ca t'aidera.